Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OptnQ8K3K8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms