Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms