Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox30Q8CGW4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox30Q8CGW4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox30Q8CGW4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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