Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms