Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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