Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms