Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb2Q8CC27 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacnb2Q8CC27 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms