Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ephb1Q8CBF3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ephb1Q8CBF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ephb1Q8CBF3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ephb1Q8CBF3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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