Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms