Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Atg4aQ8C9S8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Atg4aQ8C9S8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Atg4aQ8C9S8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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