Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col6a6Q8C6K9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col6a6Q8C6K9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col6a6Q8C6K9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col6a6Q8C6K9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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