Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms