Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdrpQ8C5P7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms