Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac7Q8C2B3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms