Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8C1R3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms