Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpcpd1Q8C0L9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms