Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim35Q8C006 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim35Q8C006 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim35Q8C006 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim35Q8C006 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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