Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn17Q8BXA6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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