Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms