Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms