Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms