Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms