Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm2Q80W85 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms