Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ell3Q80VR2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ell3Q80VR2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms