Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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