Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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