Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT15

Galnt17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt17Q7TT15 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Galnt17Q7TT15 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Galnt17Q7TT15 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Galnt17Q7TT15 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Galnt17Q7TT15 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Galnt17Q7TT15 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Galnt17Q7TT15 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Galnt17Q7TT15 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms