Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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