Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms