Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD1

Fbxo11, F-box only protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo11Q7TPD1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms