Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms