Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms