Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms