Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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