Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms