Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Atp8b3Q6UQ17 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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