Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms