Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig3Q6P1C6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms