Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms