Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms