Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rftn1Q6A0D4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rftn1Q6A0D4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms