Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcncQ62447 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms