Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nptx1Q62443 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms