Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms