Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms