Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ss18Q62280 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ss18Q62280 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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