Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms