Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttf1Q62187 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttf1Q62187 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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