Protein–RNA interactions for Protein: Q62168

Krt32, Keratin, type I cuticular Ha2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt32Q62168 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt32Q62168 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt32Q62168 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt32Q62168 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt32Q62168 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt32Q62168 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms