Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msi1Q61474 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msi1Q61474 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msi1Q61474 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msi1Q61474 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msi1Q61474 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msi1Q61474 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms